Alphabetical Indicies

If your browser is equipped with a CML aware plug-in, then the CML will be processed to render a 2D or 3D model of the molecular structure.

If your browser is NOT CML aware, then you can use the "Jumbo3" program included on the cdrom, to render the CML file.

Select from

Pontamine Black AWG Nc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(N=Nc4ccc5c(cccc5S(=O)(=O)O)c4N)cc3)c(cc6cc(c(N=Nc7ccccc7)c(O)c16)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Black E Nc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(N=Nc4ccc(N)cc4N)cc3)c(cc5cc(c(N=Nc6ccccc6)c(O)c15)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Black EBN Nc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(N=Nc4ccc(N)cc4N)cc3)c(cc5cc(c(N=Nc6ccccc6)c(O)c15)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Black RR Nc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(N=Nc4cc(C)c(N)cc4N)cc3)c(cc5cc(c(N=Nc6ccccc6)c(O)c15)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Black RRX Nc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(N=Nc4cc(C)c(N)cc4N)cc3)c(cc5cc(c(N=Nc6ccccc6)c(O)c15)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Blue 3BX Oc1c(N=Nc2ccc(cc2C)c3ccc(N=Nc4c(O)c5c(N)cc(cc5cc4S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O)c(C)c3)c(cc6cc(cc(N)c16)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Blue 5B Oc1c(N=Nc2ccc(cc2C)c3ccc(N=Nc4c(O)c5c(O)cc(cc5cc4S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O)c(C)c3)c(cc6cc(cc(O)c16)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Blue AX S(=O)(=O)(O)c1cc(N=Nc2ccc(cc2OC)c3ccc(N=Nc4cc(c5ccccc5c4O)S(=O)(=O)O)c(OC)c3)c(O)c6ccccc16
Pontamine Blue BB Oc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(cc3)N=Nc4c(O)c5c(N)cc(cc5cc4S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O)c(cc6cc(cc(N)c16)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Blue CLG Oc1c(N=Nc2ccc(cc2C)c3ccc(N=Nc4ccc5c(c(N)ccc5S(=O)(=O)O)c4O)c(C)c3)c(cc6cccc(c16)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Blue RW Oc1c(N=Nc2ccc(cc2OC)c3ccc(N=Nc4c(O)ccc5ccccc45)c(OC)c3)ccc6c1c(N)c(cc6S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Brown CG N(=Nc1ccc(O)c(N=Nc2ccc(cc2)S(=O)(=O)O)c1O)c3ccc(cc3)c4ccc(N=Nc5ccc(O)c(c5)C(=O)O)cc4
Pontamine Brown CR N(=Nc1c(O)ccc(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(N=Nc4ccc(O)c(c4)C(=O)O)cc3)c1O)c5ccc(c6ccccc56)S(=O)(=O)O
Pontamine Brown D3G N(=Nc1ccc(cc1)N=Nc2ccc(cc2)S(=O)(=O)O)c3ccc(N)cc3N
Pontamine Brown RMR Oc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(N=Nc4ccc(O)c(c4)C(=O)O)cc3)c(cc5ccc(N)cc15)S(=O)(=O)O
Pontamine Brown XR N(=Nc1ccc(O)c(N=Nc2ccc(cc2)S(=O)(=O)O)c1O)c3ccc(cc3)c4ccc(N=Nc5ccc(O)c(c5)C(=O)O)cc4
Pontamine Brown N(=Nc1ccc(O)c(N=Nc2ccc(cc2)S(=O)(=O)O)c1O)c3ccc(cc3)c4ccc(N=Nc5ccc(O)c(c5)C(=O)O)cc4
Pontamine Copper Blue RRX S(=O)(=O)(O)c1cc(N=Nc2ccc(cc2OC)c3ccc(N=Nc4c(O)c5ccc(N)cc5cc4S(=O)(=O)O)c(OC)c3)c(O)c6ccccc16
Pontamine Deep Blue BH Oc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(cc3)N=Nc4c(O)c5cc(N)ccc5cc4S(=O)(=O)O)c(cc6cc(cc(N)c16)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Diazo Black BHSW Oc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(cc3)N=Nc4c(O)c5cc(N)ccc5cc4S(=O)(=O)O)c(cc6cc(cc(N)c16)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Diazo Black BHid and BH Oc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(cc3)N=Nc4c(O)c5cc(N)ccc5cc4S(=O)(=O)O)c(cc6cc(cc(N)c16)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Diazo Bordeaux 7B Oc1c2ccc(Nc3ccc4c(O)c(N=Nc5cccc(N)c5)c(cc4c3)S(=O)(=O)O)cc2cc(c1N=Nc6cccc(N)c6)S(=O)(=O)O
Pontamine Diazo Green 3G N(=Nc1c(O)c2ccc(NC(=O)c3ccc(N)cc3)cc2cc1S(=O)(=O)O)c4c(OCC)cc(N=Nc5cc(Cl)c(cc5Cl)S(=O)(=O)O)c6cc(ccc46)S(=O)(=O)O
Pontamine Diazo Orange 2R S(=O)(=O)(O)c1cc(cc2ccc(N=Nc3ccc(NC(=O)c4ccc(cc4)N=Nc5c(O)c6ccc(NC(=O)c7ccc(N)cc7)cc6cc5S(=O)(=O)O)cc3C)cc12)S(=O)(=O)O
Pontamine Diazo Red 5BL Oc1c2ccc(NC(=O)c3cccc(NC(=O)c4ccc(N)cc4)c3)cc2cc(c1N=Nc5ccc(cc5)N=Nc6ccc(cc6)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Diazo Scarlet 2BL Oc1c2ccc(NC(=O)Nc3ccc4c(O)c(N=Nc5cccc(N)c5)c(cc4c3)S(=O)(=O)O)cc2cc(c1N=Nc6cccc(N)c6)S(=O)(=O)O
Pontamine Diazo Scarlet A and R Oc1c2ccc(NC(=O)c3cccc(N)c3)cc2cc(c1N=Nc4ccccc4)S(=O)(=O)O
Pontamine Diazo Yellow 2GL S(=O)(=O)(O)c1cc(ccc1NC(=O)c2ccc(N)cc2)NC(=O)Nc3ccc(NC(=O)c4ccc(N)cc4)c(c3)S(=O)(=O)O
Pontamine Fast Blue RRL N(=Nc1cc(OC)c(N=Nc2c(O)c3ccc(Nc4ccccc4)cc3cc2S(=O)(=O)O)cc1C)c5cc(cc6cc(cc(O)c56)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Fast Heliotrope B Oc1c2ccc(Nc3ccccc3)cc2cc(c1N=Nc4cc(C)c(N=Nc5c(C)cc(C)cc5S(=O)(=O)O)cc4OC)S(=O)(=O)O
Pontamine Fast Heliotrope BL Oc1c2ccc(Nc3ccccc3)cc2cc(c1N=Nc4cc(C)c(N=Nc5c(C)cc(C)cc5S(=O)(=O)O)cc4OC)S(=O)(=O)O
Pontamine Fast Orange S Oc1c2ccc(NC(=O)Nc3ccc4c(O)c(N=Nc5ccccc5)c(cc4c3)S(=O)(=O)O)cc2cc(c1N=Nc6ccccc6)S(=O)(=O)O
Pontamine Fast Red 8BLX Oc1c2ccc(NC(=O)c3ccccc3)cc2cc(c1N=Nc4ccc(cc4)N=Nc5ccc(cc5)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Fast Scarlet 4BA S(=O)(=O)(O)c1ccc2cc(N)ccc2c1
Pontamine Fast Scarlet 4BS Oc1c2ccc(NC(=O)Nc3ccc4c(O)c(N=Nc5ccccc5)c(cc4c3)S(=O)(=O)O)cc2cc(c1N=Nc6ccc(cc6)NC(C)=O)S(=O)(=O)O
Pontamine Fast Scarlet G Oc1c2ccc(NC(=O)Nc3ccc4c(O)c(N=Nc5ccccc5)c(cc4c3)S(=O)(=O)O)cc2cc(c1N=Nc6ccc7cc(ccc7c6)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Fast Yellow 5GL N(=Nc1ccc(cc1)NC(=O)Nc2ccc(cc2)N=Nc3ccc(O)c(c3)C(=O)O)c4ccc(O)c(c4)C(=O)O
Pontamine Fast Yellow BBL S(=O)(=O)(O)c1c(C)ccc2N=C(Sc12)c3ccc4N=C(Sc4c3)c5ccc(N=Nc6ccc(cc6)C7=Nc8ccc(cc8S7)C9=Nc%10ccc(C)c(c%10S9)S(=O)(=O)O)cc5
Pontamine Garnet R S(=O)(=O)(O)c1cc(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(cc3)N=Nc4cc(c5ccccc5c4O)S(=O)(=O)O)c(N)c6ccccc16
Pontamine Green BXN Oc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(N=Nc4ccc(O)cc4)cc3)c(cc5cc(c(N=Nc6ccc(cc6)[N+](=O)[O-])c(N)c15)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Green GXN Oc1c(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(N=Nc4ccc(O)cc4)cc3)c(cc5cc(c(N=Nc6ccc(cc6)[N+](=O)[O-])c(N)c15)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Light Yellow 5GX N(=Nc1ccc(cc1)NC(=O)Nc2ccc(cc2)N=Nc3ccc(O)c(c3)C(=O)O)c4ccc(O)c(c4)C(=O)O
Pontamine Orange R S(=O)(=O)(O)c1cc(N=Nc2ccc(cc2)c3ccc(N=Nc4ccc(O)c(c4)C(=O)O)cc3)c(N)c5ccccc15
Pontamine Pink 2B S(=O)(=O)(O)c1c(C)ccc2N=C(Sc12)c3ccc(cc3)N=Nc4cc(c5ccccc5c4O)S(=O)(=O)O
Pontamine Pure Yellow MN S(=O)(=O)(O)c1c(C)ccc2N=C(Sc12)c3ccc(N=NNc4ccc(cc4)C5=Nc6ccc(C)c(c6S5)S(=O)(=O)O)cc3
Pontamine Pure Yellow S(=O)(=O)(O)c1c(C)ccc2N=C(Sc12)c3ccc(N=NNc4ccc(cc4)C5=Nc6ccc(C)c(c6S5)S(=O)(=O)O)cc3
Pontamine Scarlet 3B N(=Nc1ccc(cc1C)c2ccc(N=Nc3ccc(OCC)cc3)c(C)c2)c4c(O)ccc5cc(cc(c45)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Scarlet B N(=Nc1ccc(cc1)c2ccc(N=Nc3ccc(OCC)cc3)cc2)c4c(O)ccc5cc(cc(c45)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Sky Blue 5 BX Oc1c(N=Nc2ccc(cc2OC)c3ccc(N=Nc4c(O)c5c(N)cc(cc5cc4S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O)c(OC)c3)c(cc6cc(cc(N)c16)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Sky Blue 5BX Oc1c(N=Nc2ccc(cc2OC)c3ccc(N=Nc4c(O)c5c(N)cc(cc5cc4S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O)c(OC)c3)c(cc6cc(cc(N)c16)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O
Pontamine Sky Blue 6BX Greenish S(=O)(=O)(O)c1cc(c(N)c2c1ccc(N=Nc3ccc(cc3OC)c4ccc(N=Nc5ccc6c(cc(c(N)c6c5O)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O)c(OC)c4)c2O)S(=O)(=O)O
Pontamine Sky Blue 6BX S(=O)(=O)(O)c1cc(c(N)c2c1ccc(N=Nc3ccc(cc3OC)c4ccc(N=Nc5ccc6c(cc(c(N)c6c5O)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O)c(OC)c4)c2O)S(=O)(=O)O
Pontamine Sky Blue 6X S(=O)(=O)(O)c1cc(c(N)c2c1ccc(N=Nc3ccc(cc3OC)c4ccc(N=Nc5ccc6c(cc(c(N)c6c5O)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O)c(OC)c4)c2O)S(=O)(=O)O
Pontamine Sky Blue S(=O)(=O)(O)c1cc(c(N)c2c1ccc(N=Nc3ccc(cc3OC)c4ccc(N=Nc5ccc6c(cc(c(N)c6c5O)S(=O)(=O)O)S(=O)(=O)O)c(OC)c4)c2O)S(=O)(=O)O
Pontamine Violet N N(=Nc1ccc(cc1)c2ccc(cc2)N=Nc3c(N)ccc4cc(cc(O)c34)S(=O)(=O)O)c5c(N)ccc6cc(cc(O)c56)S(=O)(=O)O
Pontamine Yellow CH C(=Cc1ccc(N=Nc2ccc(OCC)cc2)cc1S(=O)(=O)O)c3ccc(N=Nc4ccc(OCC)cc4)cc3S(=O)(=O)O


The Random Factory - 2001